Une 3ème administration est le Sicherheistdienst (S.D.) appelé à tort Gestapo. 2 antennes qui relèvent du Kommando de Dijon sont installées à Dole et Besançon. La mission du S.D. est d’assurer la sécurité, leur sécurité : lutter contre les Résistants, les agents étrangers, les juifs, les « indésirables ».